一是危害的隱蔽性。農產品特別是食用農產品，常常需經過輔料搭配、蒸煮、煎炒等烹飪加工才能食用。受物理性、化學性和生物性污染的農產品在這些食用加工過程中，農產品質量安全的真實水平或程度往往得以掩飾，很難憑感觀或一般檢測設備進行識別。并且，一些參數或指標的檢測難度進一步加大，檢測時間進一步延長，質量安全狀況難以及時準確判斷，危害具有較強的隱蔽性。
二是危害的單一性。農產品的生產環節相對單一，影響質量水平的不安全因素主要來自農業生產過程。土壤、大氣、灌溉水等產地環境含有的有毒有害物質，化肥、飼料、農藥、獸藥等含有的有毒有害成分，均可能在農產品中直接殘留，危害環節相對單一，危害因素常以化學性污染物為主。
三是危害的多發性。化肥、飼料、農藥、獸藥是農產品生產的重要投入品。當前，我國農藥、獸藥農業生產資料市場相當混亂，一些農業投入品專業技術人員都難以識別，對科學文化素質還不太高的農民來說，更是難以準確判斷，加上農業投入品使用的不規范和工業“三廢”排放造成的面源污染，使得農產品質量安全事故呈多發態勢。但由于農產品生產規模一般較小，生產周期較長，受影響的農產品數量較少，且由于流通銷售半徑相對較小，其質量安全的危害一般較小。
四是管理的復雜性。農產品屬于第一產業范疇，生產周期長。產地環境是完全開放的自然地理環境，很難人為控制。生產者以高度分散的、小規模農戶為主，規模化、組織化、機械化程度均很低，素質參差不齊，化肥、農藥、獸藥、飼料等農業投入品的使用情況差異巨大，污染農產品的途徑眾多，農產品質量安全管理十分復雜。目前，農產品質量安全管理一般以農業部門為主、依據《農產品質量安全法》進行，難度很大。

編輯：foodqa